1.万历自己的出生经历是一个障碍。
万历作为皇帝是奇葩，为废长立幼的事，和文官集团斗了一辈子，甚至后来不理朝政达数十年之久。后来发生的明朝三大奇案，也与此不无关系。所以，后人认为，明朝实际灭亡在万历手中，透过历史的雾霾，我认为，这话是有一定道理的。
万历梦寐以求地要立福王为太子，遭到了生身母亲李太后的强烈反对。而万历能当皇帝，与李太后的坚决支持戚戚相关。有一次万历理屈词穷时，口不择言：“长子出身卑贱乃宫女所生”，李太后寸言不让，立即还击：“你也是宫女生的，我也出身卑贱“。这话是事实，也只有李太后敢于说出来，万历立即焉了。尽管已坐北朝南了二十余载，当时却汗如雨下，口不能言。他是自身理亏，以此来责难长子显然是强词夺理，是站不住脚的。
2.万历皇帝的做法不像是立太子，而像是争夺权力，这让文官集团很不服气，在这件事上与他严重对立起来。
其实，万历本人就是立嫡立长制度的受益者，“嫡庶之别”、“长幼之分”在明朝的开国皇帝朱元璋眼里看得好重。现在看来，如果万历真想立福王为太子，可以以皇后无出的名义废掉皇后。再立郑贵妃为皇后，这样福王当太子也就是顺理成章的事了。他为什么一直没有这样做呢？显然，废长立幼事件后来转变成为万历打压文官集团的一种的手段，令人啼笑皆非的“争国本”事件持续了15年。在此期间，万历拿出一言九鼎的作派，凡在这件事上与自己意见不一致的大臣都被贬斥。所以，后来的太子之争，演变成了“权力”的争夺。也让文官集团疏远了他。
3.万历皇帝在废长立幼这件事上孤掌难鸣，没有支持者。
李太后坚决反对，文官集团顽强抵制。而皇后自己无子，尽管没有表态，但显而易见地，如果依附李太后的意见，无疑是皇后的自保之道。如果立福王为太子，自己的皇后位置也坐不长了。如果朱常洛被立为太子，王恭妃母子一定会对自己感恩戴德的，自己的地位也就安全了 。这一曲，万历不知道看明白没有！
万历在这件事上，最后以失败而告终。在公元1601年即万历二十九年十月，万历皇帝不得不正式封长子朱常洛为太子，这真有敬酒不吃吃罚酒的意思。15年的国本之争落下帷幕后，大明已经精疲力竭了，距离亡国之日已不过43年的时间了。
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