影响很深远，实际上“国本之争”已经不再是单纯的该拥立朱常洛还是朱常洵为太子的争论，它演变到后期已经发展成为“臣子和皇帝”的势力角逐，影响了后面三位皇帝的政治格局，君权至上的年代皇帝的权力是不是真的毫无制衡?而大臣是不是真的一切都要以皇帝马首是瞻?“国本之争”实际上给出了答案，它的意义是非凡的，我们都知道明清两朝是君主集权的最高峰，皇帝的权力达到了前所未有的高度，但是在一切大事都需要皇帝予以裁决的情况下，万历皇帝却无法逾越礼制把朱常洵设为太子，这说明臣子也有他们的底线，皇帝也并非可以为所欲为。“国本之争”的第一层影响“国本之争”前前后后持续十五年才落下帷幕，最终以万历皇帝的妥协而结束，并且还是在李太后的干预下，朱常洛最终才被册封为太子，这预示着君权实际上已经被削弱，明朝的文官的力量无形间得到了壮大，形成“君弱臣强”的局面。
明朝官僚最大的群体就是“东林党”，但是我们可以透过嘉靖皇帝的“大礼议”事件得到启发，嘉靖皇帝通过铁腕手段强力打压群臣，君权赢得胜利，让嘉靖在二十年不上朝的情况下依然可以强而有力的掌控群臣。但万历皇帝的妥协却意味着群臣拥有了逼迫皇帝妥协的资本和底气，因此，自万历皇帝以后，裁决权实际上已经从皇帝手中被分流了一部分至臣子手里，在很多问题上皇帝无法按照自己的意愿做出决定，也就不难怪崇祯皇帝死的时候为什么说“然皆诸臣误朕”。
“国本之争”的第二层影响在“国本之争”期间，还发生了著名的“宫廷三大案”，这三大案的源头是“国本之争”，不过这三大案的本质却是以郑贵妃为首的后宫势力、皇帝以及大臣三方力量的相互角逐。“国本之争”的主角明光宗朱常洛登基仅仅一个月就因吞食“红丸”而驾崩，明光宗的死实际上就是因为群臣耽误病情导致，这其中当然也有郑贵妃的影子。如果说“宫廷三大案”是后宫郑贵妃为了进一步独揽后宫权力，甚至培养李选侍进一步染指朝政，那么在同后宫势力对抗的过程中，整个明朝群臣的胜利虽然进一步捍卫了君权，但实际上更进一步的增强了群臣的政治力量，而这又导致天启皇帝利用宦官来钳制文官群体，但是却又让宦官做大。“国本之争”从万历皇帝开始，它的影响一直持续到明朝灭亡才结束，使得明朝的政治越发腐败和无能，国家大事逐渐沦为政治角逐的斗争，从而让明帝国一步步走向灭亡。
“国本之争”对明朝的影响必然是深远的，它从根本上动摇了这个帝国的政治稳定和平衡，由此使明朝晚期进入愈演愈烈的党争之中，从此朝纲败坏，国家大事束之高阁，或沦为政治角逐的意气之争。可以说，明朝灭亡的原因之一中，“国本之争”带来的后续影响占据了一个很重要的原因。
标签： 国本之争
