府院之争指总统和总理之间的斗争。北洋时期，共出现了2次府院之争，第一次是黎元洪和段祺瑞之间的斗争，第二次是黎元洪和冯国璋之间的斗争。这2次斗争，他们3人谁成了最后赢家？
1911年10月8日，武汉爆发了武昌起义。随后各地纷纷响应，这让存在了两百多年的大清，走向了穷途末路。虽然辛亥革命后，大清已经无力控制局势了，而革命党人气势如虹，蒸蒸日上，但由于革命党人手中并没有多少军队，要与手握新军的清廷和袁世凯对抗，还是缺乏胜算。
在这个背景下，袁世凯为了自身利益，开始从中斡旋，推动了清廷和革命党人的议和。袁世凯通过威逼利诱，逼迫清廷颁布了退位诏书，但也为满清皇室争取到了《清室优待条件》。同时，革命党人为了拉拢袁世凯，提出愿意让袁世凯做民国大总统，这让革命果实落在了袁世凯之手。
袁世凯当上民国大总统之后，其贪心不足，想要称帝。不久后，袁世凯倒行逆施，登基称帝了。而袁世凯的称帝之举，不但引起了革命党人和天下百姓的不满，其手下的北洋将领，也对他颇有不满。这让袁世凯一时间，陷入了众叛亲离之中，导致他只当了83天皇帝，就在反袁浪潮中宣布废除帝制。此事给袁世凯的打击很大，退位后，他就病倒了，并在当年病重去世。
袁世凯去世后，民国开始施行责任内阁制。同时，他手下的北洋将领，也陷入了群龙无首，内斗不断的局面。段祺瑞是北洋三杰之一的“北洋之虎”，还是皖系军阀首领，所以他做了内阁首领，这让权力落在了段祺瑞之手。代表革命党人利益的民国副总统黎元洪，做了民国大总统。
黎元洪原本是清朝将领，在湖北新军中拥有着很高的威望，所以革命党人和清廷都想拉拢黎元洪。清廷想借助黎元洪的新军镇压革命党人，革命党人想拉拢黎元洪来对抗清廷。武昌起义爆发后，对黎元洪颇有好感的革命党人，将他推举为了湖北都督，让黎元洪成了革命党人的利益代表。
南北议和之后，袁世凯做了民国大总统，而黎元洪代表革命党人做了民国副总统。袁世凯去世后，黎元洪接替他做了民国代总统，段祺瑞做了内阁总理，但由于袁世凯去世后，民国开始施行责任内阁制，所以权力由总统转移到了总理身上，总统黎元洪成了总理段祺瑞的盖章机器。
黎元洪不甘愿做段祺瑞的“行走的盖章机器”，两人之间的“府院之争”就爆发了。两人斗争最激烈的时候，黎元洪下令免去了段祺瑞的总理职务，这让段祺瑞气愤不已，然后策划武装倒黎。
黎元洪为了对抗段祺瑞，联络张勋对抗段祺瑞，但是张勋率兵入京后，却倒行逆施，又扶持小皇帝溥仪称帝了。张勋的这场复辟闹剧，只持续了12天时间，就被段祺瑞的讨逆军给击败了。
由于张勋的复辟闹剧，段祺瑞又因为拥护共和有功，重返了政坛，而黎元洪只能辞去民国总统一职，到天津隐居起了。在黎元洪和段祺瑞之间的第一次“府院之争”中，以段祺瑞的完胜而结束。
黎元洪辞职之后，总统之位空缺了出来，段祺瑞邀请冯国璋进京做了代理总统，段祺瑞继位做内阁总理。
冯国璋是北洋三杰之一的“北洋之豹”，但由于太过听袁世凯的话，所以被人们称为“北洋之狗”。冯国璋和段祺瑞一样，也是北洋系中的大佬，他是直系军阀的首领，实力能力都很强。
手中没有多少军队的黎元洪，都不愿做段祺瑞的傀儡，手中有地盘、有军队、有实力的冯国璋，自然更不会甘心做段祺瑞的“行走的盖印机器”，所以两人之间爆发了第二次“府院之争”。
两人最开始在西南军阀及广东护法军政府的政策上，产生了矛盾。段祺瑞主张“武力统一”，借此扩充自己的皖系势力，而冯国璋主张“和平统一”，以此来讨好西南军阀，保护直系的利益。
1917年8月，段祺瑞不顾及冯国璋的意见，发动了南北战争(护法战争)，但随后，直系军阀中的将领，纷纷发电议和，这给了段祺瑞很大的压力，他最终被迫辞去了内阁总理一职，但段祺瑞并不会就此认输，随后他策动北方十督：曹锟、张怀芝、张作霖、倪嗣冲、阎锡山、陈树藩、赵倜、杨善德、卢永祥、张敬尧等人，在天津举行督军团会议，联名电请冯国璋明令讨伐西南。
面对压力，冯国璋只能让步，他让段祺瑞做了参战督办。同年11月，北方十督曹锟等发表通电，主张以皖系控制的临时参议会代行国会职权，选举正式大总统，企图“合法倒冯”。面对皖系的步步紧逼，冯国璋以讨伐西南为由，准备南下，回到自己控制的直系大本营南京，但车刚到蚌埠，他就被皖系安徽督军倪嗣冲拦截，被迫回京。同时，张作霖的奉军也入关“兵谏”。
皖奉联合之后，冯国璋难以招架，被迫让段祺瑞做了内阁总理，但是在1918年9月4日，国会选举徐世昌为新任民国大总统，段祺瑞和冯国璋双双下野，两人谁也没有赢下“府院之争”。
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